复杂度测序数据,让研究人员在处理过程中面临诸多困难面,大规模测序数据的分析消耗资源,如硬件资源、时间成本等;另一方面,计算分析过程中必然涉及到的大量宏基因组学计算分析工具很难由普通使用者自行部署、调试与维护。文中对比了领域内主流的宏基因组学计算平台,
2021-04-19 10:54
作为植物细胞器的重要组成部分和光合作用的器官司,叶绿体在生物进化的漫长历史中发挥了重要作用。
2010-11-21 12:34
/Cas9 存在严重的脱靶性,即该技术可以发生非特异性切割,引起基因组非靶向位点的突变,这样会造成研究结果的不确定性以及研究工作的大量增加,这一问题严重地限制了 Cas9 的应用。 因此科学家们希望能通过全基因组检测脱靶剪切,近年来研发了不少检测脱靶剪切酶活性的实
2017-09-24 10:49
./oschina_soft/canu.zip
2022-06-21 11:39
基于高性能计算集群这样的新一代测序器和快速演化分析平台,基因研究领域已经被海量数据淹没。众多基因、癌症、医学研究机构和制药公司不断产生的海量数据,已不再能被及时的处理并恰当的存储,甚至通过常规通讯
2017-10-11 09:46
全基因组测序的优势目前,随着高通量测序技术快速发展、测序成本的进一步降低以及组装方法的不断完善,全基因组测序研究主要包括3个方面。第一种为不参考任何现有序列从头组装测序,是对未知基因组序列的物种进行
2021-07-29 08:31
除了利用aCGH和snp芯片来检测CNV之外,也可以通过NGS数据来分析CNV, 比如全基因组和全外显子测序。针对全基因组CNV的检测,还针对开发了一种称之为C...
2021-07-29 08:24
1、使用Arm服务器减少基因组学的时间和成本 我们现在可以展示三种主要aligners在Arm架构AWS Graviton3上的性能。AWS Gravaton3是AWS服务器系列中最新的基于Arm
2022-10-09 16:32
人类基因组计划的开展随之产生了巨量的基因组信息,区分DNA 序列上的外显子和内含子成为基因工程中对基因进行识别和鉴定关键环节之一[1]。如何建立良好的系统模型将
2009-06-23 14:01
高通量测序技术的发展,极大地推动了基因组结构变异识别的研究,当前,该领域主要使用覆盖度、读分割或片段组装方法来识别变异,但目前的方法识别结果不够准确,敏感度高,对基因组结构变异的信息(如变异序列
2017-12-25 11:38